[00902158]一种基于卷积神经网络的DNA绑定残基预测方法
交易价格:
面议
所属行业:
网络
类型:
发明专利
技术成熟度:
正在研发
专利所属地:中国
专利号:CN202010918314.5
交易方式:
其他
联系人:
所在地:浙江杭州市
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技术详细介绍
一种基于卷积神经网络的DNA绑定残基预测方法,首先,根据输入残基数为L的待进行DNA绑定残基预测的蛋白质序列信息,分别使用HHblits、PSIPRED、SANN和I-LBR程序获取特征矩阵PSFM、PSS、PSA和ILBR;然后,将以上四个矩阵组合为一个特征矩阵F并将其转化为特征张量;其次,我们将蛋白质序列处理成残基样本;再次,搭建卷积神经网络,利用已知绑定残基的蛋白质序列构建数据集并训练所搭建的网络;最后,将待进行预测的蛋白质序列的残基样本输入到训练的模型中,根据模型输出概率是否大于判定阈值threshold,进而判断对应的残基是否为DNA绑定残基。本发明计算代价小、预测精度高。
一种基于卷积神经网络的DNA绑定残基预测方法,首先,根据输入残基数为L的待进行DNA绑定残基预测的蛋白质序列信息,分别使用HHblits、PSIPRED、SANN和I-LBR程序获取特征矩阵PSFM、PSS、PSA和ILBR;然后,将以上四个矩阵组合为一个特征矩阵F并将其转化为特征张量;其次,我们将蛋白质序列处理成残基样本;再次,搭建卷积神经网络,利用已知绑定残基的蛋白质序列构建数据集并训练所搭建的网络;最后,将待进行预测的蛋白质序列的残基样本输入到训练的模型中,根据模型输出概率是否大于判定阈值threshold,进而判断对应的残基是否为DNA绑定残基。本发明计算代价小、预测精度高。