[00275337]一种基于分子动力学模拟筛分黄酮类化合物抗雄活性方法
交易价格：
面议
所属行业：
分析仪器
类型：
发明专利
技术成熟度：
正在研发
专利所属地：中国
专利号：CN201610806127.1
交易方式：
技术转让
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技术入股
联系人：
南京大学
进入空间
所在地：江苏南京市
- 服务承诺
- 产权明晰
-
资料保密
对所交付的所有资料进行保密
- 如实描述
技术详细介绍
本发明公开了一种基于分子动力学模拟筛分黄酮类化合物抗雄活性方法，受试黄酮化合物结构经过优化后和同源模建获得的受体文件进行对接组成复合物，然后用GROMACS软件包进行分子动力学模拟20纳秒，计算黄酮化合物受体的12号螺旋8～20ns均方根偏差，将数据导入R语言包，计算出的标准偏差及残差建立区分模型，再将模糊区域中的化合物通过考察其在受体中的运动轨迹及计算的均方根偏差，排除无活性化合物。本发明首次引入定量判断，并运用定量和定性结合来提高预判的精确度，使得抗性和无抗性黄酮的区分率达到87.5％，无抗性黄酮的筛除率达到90％，不仅能够大幅削减实验室工作量，减少试验品消耗，节约资源，还能大幅提高QSAR预测的准确性，使得QSAR能够真正实现应用。
本发明公开了一种基于分子动力学模拟筛分黄酮类化合物抗雄活性方法，受试黄酮化合物结构经过优化后和同源模建获得的受体文件进行对接组成复合物，然后用GROMACS软件包进行分子动力学模拟20纳秒，计算黄酮化合物受体的12号螺旋8～20ns均方根偏差，将数据导入R语言包，计算出的标准偏差及残差建立区分模型，再将模糊区域中的化合物通过考察其在受体中的运动轨迹及计算的均方根偏差，排除无活性化合物。本发明首次引入定量判断，并运用定量和定性结合来提高预判的精确度，使得抗性和无抗性黄酮的区分率达到87.5％，无抗性黄酮的筛除率达到90％，不仅能够大幅削减实验室工作量，减少试验品消耗，节约资源，还能大幅提高QSAR预测的准确性，使得QSAR能够真正实现应用。
